Análisis transcriptómico de comunidades microbianas de la maduración de queso - Bertin Technologies

Análisis transcriptómico de comunidades microbianas de la maduración de queso

Sources: Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, UMR SayFood,  Thiverval-Grignon, Francia

Context

Los cultivos de maduración que contienen hongos y bacterias tienen un papel fundamental en la producción de quesos de corteza lavada. Desafortunadamente, se conoce poco acerca de las interacciones bióticas dentro de estas comunidades microbianas en la superficie del queso, exceptuando el impacto positivo del aumento del pH iniciado por hongos en el crecimiento de diversas bacterias sensibles al ácido, tales como Brevibacterium aurantiacum y Hafnia alvei. En este trabajo se exploran , las interacciones bióticas de una comunidad de maduración de queso compuesta de Debaryomyces hansenii, Brevibacterium aurantiacum y Hafnia alvei gracias al uso de un modelo de quesos miniatura a escala de laboratorio que reproduce las condiciones en el proceso de maduración del queso. El desarrollo de técnicas de secuenciación de nueva generación (NGS) durante la última década, permite actualmente a los investigadores analizar el transcriptoma de múltiples especies presentes en una misma muestra simultáneamente.  En la presente nota de aplicación, se usó una técnica relativamente novedosa de secuenciación de ARN dual, para capturar el transcriptoma de D. hansenii, B. aurantiacum y H. alvei y analizar las interacciones metabólicas entre estas especies en la superficie del queso.

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